中國科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所（以下簡稱“亞熱帶生態(tài)所”）創(chuàng)建于1978年，其前身為中國科學(xué)院長沙農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化研究所，2003年10月改為現(xiàn)名。
亞熱帶生態(tài)所主要學(xué)科方向為亞熱帶復(fù)合農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)學(xué)，下設(shè)喀斯特區(qū)域農(nóng)業(yè)生態(tài)研究中心、農(nóng)田生態(tài)研究中心、濕地農(nóng)業(yè)生態(tài)研究中心、流域農(nóng)業(yè)環(huán)境研究中心、畜禽健康養(yǎng)殖與農(nóng)牧復(fù)合生態(tài)研究中心、作物分子生態(tài)研究中心等六個研究中心，作為依托單位擁有畜禽養(yǎng)殖污染控制與資源化技術(shù)國家工程實驗室、中國科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)過程重點實驗室、農(nóng)業(yè)生態(tài)工程湖南省重點實驗室、動物營養(yǎng)生理與代謝過程湖南省重點實驗室、湖南省畜禽健康養(yǎng)殖工程技術(shù)研究中心和廣西石漠化治理工程技術(shù)研究中心，建有桃源農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)觀測研究站、環(huán)江喀斯特生態(tài)系統(tǒng)觀測研究站、洞庭湖濕地生態(tài)系統(tǒng)觀測研究站和長沙農(nóng)業(yè)環(huán)境觀測研究站?！ ?/p>
截至2023年底，亞熱帶生態(tài)所共有在冊職工203人。其中，中國工程院院士1人，國家“杰青”1人，國家“優(yōu)青”2人（含海外項目1人），國家百千萬人才高層次人選2人，國家高層次人才特殊支持計劃入選者6人，全國優(yōu)秀科技工作者1人，國家“創(chuàng)新人才推進計劃”中青年科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才1人、重點領(lǐng)域創(chuàng)新團隊2個，享受國務(wù)院政府特殊津貼專家11人，中國科學(xué)院人才引進計劃入選者9人、創(chuàng)新（青年）交叉團隊2個、青年促進會會員20人、青年促進會優(yōu)秀會員6人、特聘研究崗位人員28人、“西部之光”入選者25人、“王寬誠率先人才計劃”產(chǎn)研人才扶持項目1人，湖南省人才引進計劃入選者2人、“杰青”13人、“優(yōu)青”2人、科技領(lǐng)軍人才5人、121創(chuàng)新人才培養(yǎng)工程入選者5人、光召科技獎1人，“十大同心人物”2人、享受湖南省政府特殊津貼專家2人、湖湘青年英才6人、“三尖”創(chuàng)新人才14人，廣西省八桂學(xué)者2人，八桂青年學(xué)者2人。
現(xiàn)擁有生態(tài)學(xué)博士學(xué)位授予點，生態(tài)學(xué)、畜牧學(xué)以及環(huán)境工程學(xué)碩士學(xué)位授予點；有生態(tài)學(xué)專業(yè)學(xué)科博士后流動站。目前在讀研究生192人（含國際學(xué)生2任），其中碩士生96人，博士生96人，在站博士后50余人。
亞熱帶生態(tài)所是湖南省生態(tài)學(xué)會、湖南省土壤學(xué)會、湖南省動物營養(yǎng)與生態(tài)環(huán)境學(xué)會掛靠單位，主辦有《農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化研究》期刊。